国家人类基因组南方研究中心于1998年10月成立于上海浦东张江高科技园区,是由国家和上海地区相关领域科研单位共同发起组建的一家为实现国家科研计划,进行有关人类基因组研究和应用开发的国家级新型科研机构。中心下设基因组测序部,遗传学研究部,功能基因学部,比较基因组学部,生物信息学部,伦理法律与社会问题部等六个研究部,拥有一支由2位中国科学院院士领衔,20位博士和30位硕士组成的高素质员工队伍。在基因组学、转录组学、蛋白质组学和人类遗传性疾病等方面都取得了优异的成绩,先后承担过人类基因组计划中国部分、黑猩猩基因组计划(22号染色体)、水稻基因组计划(粳稻4号染色体)等国际合作项目和日本血吸虫基因组计划、表观遗传学研究等80多个重大项目,在国际权威学术刊物发表论文一百多篇,申报专利近五百项,荣获国家和上海市奖励22项,已发展成为有世界影响力的研究结构。
国家人类基因组南方研究中心拥有分子生物学实验室面积6000平方米和进行分子生物学实验的基本仪器和设备;拥有各类大型仪器和设施,包括ABI3730测序仪和最新的超高通量测序仪454GS-FLX;拥有SUN3500、SUN450和最新的SGI Alex450服务器等,可满足大批量数据的高通量运算。
国家人类基因组南方研究中心基因组测序部自1999年起开始从事微生物的基因组研究工作,至今已完成了41株微生物的基因组测序工作,包括病原微生物(勾端螺旋体赖株和法国株、结核分枝杆菌无毒株H37Ra、猪胸膜肺炎球菌等),工业微生物(红色糖多孢菌、保加利亚乳酸杆菌等),古细菌和蓝藻等。相关文章分别发表在《Nature》,《GenomeResearch》,《Mol Microbiology》,《PNAS》和《PLoSOne》等国际一流学术刊物上,拥有一支优秀的进行微生物基因组测序和数据分析的团队。
2003年,在我国SARS爆发之际,国家人类基因组南方研究中心开展了SARS病毒的分子流行病学的研究和起源进化分析工作,完成了61株SARS冠状病毒的基因组序列测定,研究成果发表在国际一流学术期刊《Science》上。
国家人类基因组南方研究中心长期从事在我国最为严重的寄生虫-日本血吸虫的功能基因组学研究,先后完成了日本血吸虫的转录组学研究和蛋白质组学研究,文章分别发表在《NatureGenetics》和《PLoS Pathogen》上面。而日本血吸虫的基因组工作目前也已完成并对外公布了数据(基因组大小为390Mb)。
在长期的工作中,国家人类基因组南方研究中心了建立了一整套成熟的基因组数据分析和转录组数据分析流程,以及一支经验丰富的生物信息学队伍。为充分发挥南方中心的新一代高通量DNA测序技术平台,Roche454 FLX 和Solexa作用,推动各个研究方面的深入展开。南方中心拟招聘以下人员: